中國疾病預(yù)防控制中心始于1984年。中心有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)2個(gè)一級學(xué)科博士碩士學(xué)位授予點(diǎn)，免疫學(xué)、病原生物學(xué)、放射醫(yī)學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)、勞動(dòng)衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學(xué)、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學(xué)、少兒衛(wèi)生與婦幼保健學(xué)、衛(wèi)生毒理學(xué)等8個(gè)二級學(xué)科博士碩士學(xué)位授予點(diǎn)，以及公共衛(wèi)生碩士（MPH）專業(yè)學(xué)位學(xué)位授予點(diǎn)，其中病原生物學(xué)被評為北京市重點(diǎn)學(xué)科。截至2017年3月，現(xiàn)有導(dǎo)師共258人，其中博士生導(dǎo)師76人（含院士5名，其中中科院院士2名、工程院院士3名），碩士生導(dǎo)師154人，MPH 導(dǎo)師28人。在讀研究生582人（全日制博士生169人、全日制碩士生275名、在職公共衛(wèi)生碩士138名）。共授予博士學(xué)位812人、碩士學(xué)位2203人（其中學(xué)術(shù)型碩士學(xué)位1623人、MPH 學(xué)位580人）。中心有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)2個(gè)博士后科研流動(dòng)站，截至2017年3月，共招收博士后科研人員191人，現(xiàn)在站博士后26人。
2007年以來與澳大利亞格里菲斯大學(xué)合辦“中國疾病預(yù)防控制精英培養(yǎng)（CDCLP）”獎(jiǎng)學(xué)金項(xiàng)目，已有五批共計(jì)58名公共衛(wèi)生專業(yè)人員赴澳參加學(xué)習(xí)，其中33人獲得了MScPH（格里菲斯大學(xué)）碩士學(xué)位。2002-2016年，中心共舉辦國家級繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育項(xiàng)目822項(xiàng)，培訓(xùn)學(xué)員近9.6萬人次，其中傳染病預(yù)防控制國家級繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育基地項(xiàng)目132項(xiàng)、培訓(xùn)學(xué)員近1.5萬人次。2001-2017年，中國現(xiàn)場流行病學(xué)培訓(xùn)項(xiàng)目（CFETP）累計(jì)招收16 期共331名學(xué)員，累計(jì)有248名學(xué)員畢業(yè)；2期西部FETP共招生81名學(xué)員，76名學(xué)員已畢業(yè)。畢業(yè)學(xué)員成為各級疾控機(jī)構(gòu)的業(yè)務(wù)骨干。